FC东京队的前身是东京煤气队，1999年才宣布职业化，加盟J2参加日本职业联赛。球队在此前的最好成绩是2004年和2009年夺取过两次并不重要的联赛杯冠军。J1的最高排名为2003年的第四，天皇杯此前有两次四强经历。2010赛季球队排名联赛第16名，降入J2联赛。在2011赛季，FC东京队以23胜8平7负积77分的成绩，领先第二名12分夺得J2联赛冠军，重返J1联赛。